MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 chromosome

Total Repeats: 55948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012969	TCTG	2	8	157	164	0 %	50 %	25 %	25 %	253997714
2	NC_012969	TCAGC	2	10	186	195	20 %	20 %	20 %	40 %	253997714
3	NC_012969	GAA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997714
4	NC_012969	GAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997714
5	NC_012969	CTG	2	6	418	423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997714
6	NC_012969	AGA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997714
7	NC_012969	A	7	7	473	479	100 %	0 %	0 %	0 %	253997714
8	NC_012969	A	7	7	504	510	100 %	0 %	0 %	0 %	253997714
9	NC_012969	GC	4	8	591	598	0 %	0 %	50 %	50 %	253997714
10	NC_012969	GCC	2	6	600	605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997714
11	NC_012969	GGT	2	6	657	662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997714
12	NC_012969	TGC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997714
13	NC_012969	TGA	2	6	800	805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997714
14	NC_012969	TGT	2	6	835	840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997714
15	NC_012969	GAT	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997714
16	NC_012969	TTC	2	6	891	896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997714
17	NC_012969	ATC	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997714
18	NC_012969	GTGGAT	2	12	969	980	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	253997714
19	NC_012969	CTG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997714
20	NC_012969	CTT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997714
21	NC_012969	TGGCCA	2	12	1174	1185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253997714
22	NC_012969	A	6	6	1282	1287	100 %	0 %	0 %	0 %	253997714
23	NC_012969	ACT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997714
24	NC_012969	CTCG	2	8	1380	1387	0 %	25 %	25 %	50 %	253997714
25	NC_012969	ACG	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997714
26	NC_012969	GAA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997714
27	NC_012969	AAAT	2	8	1806	1813	75 %	25 %	0 %	0 %	253997715
28	NC_012969	CT	3	6	1835	1840	0 %	50 %	0 %	50 %	253997715
29	NC_012969	AGAA	2	8	1858	1865	75 %	0 %	25 %	0 %	253997715
30	NC_012969	CCA	3	9	1992	2000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997715
31	NC_012969	A	6	6	2009	2014	100 %	0 %	0 %	0 %	253997715
32	NC_012969	GCT	2	6	2129	2134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997715
33	NC_012969	CGT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997715
34	NC_012969	CAAG	2	8	2215	2222	50 %	0 %	25 %	25 %	253997715
35	NC_012969	GCA	2	6	2239	2244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997715
36	NC_012969	TCC	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253997715
37	NC_012969	CTG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997715
38	NC_012969	GAA	2	6	2429	2434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997715
39	NC_012969	AC	3	6	2529	2534	50 %	0 %	0 %	50 %	253997715
40	NC_012969	GAA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997715
41	NC_012969	AGA	2	6	2704	2709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997715
42	NC_012969	TGAT	2	8	2769	2776	25 %	50 %	25 %	0 %	253997715
43	NC_012969	TAA	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253997715
44	NC_012969	CAG	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997715
45	NC_012969	GTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997715
46	NC_012969	CGAT	2	8	3111	3118	25 %	25 %	25 %	25 %	253997716
47	NC_012969	ATCC	2	8	3158	3165	25 %	25 %	0 %	50 %	253997716
48	NC_012969	GCT	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
49	NC_012969	TGCA	2	8	3276	3283	25 %	25 %	25 %	25 %	253997716
50	NC_012969	GGC	2	6	3284	3289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997716
51	NC_012969	CGT	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
52	NC_012969	CCG	2	6	3418	3423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997716
53	NC_012969	CAC	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997716
54	NC_012969	TGG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
55	NC_012969	TGG	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
56	NC_012969	GCA	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997716
57	NC_012969	TGC	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
58	NC_012969	CAA	2	6	3790	3795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253997716
59	NC_012969	TGG	2	6	3811	3816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
60	NC_012969	A	6	6	3890	3895	100 %	0 %	0 %	0 %	253997716
61	NC_012969	TTC	2	6	3976	3981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997716
62	NC_012969	GTG	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
63	NC_012969	AGT	2	6	4033	4038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997716
64	NC_012969	GCC	2	6	4040	4045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997716
65	NC_012969	CTG	2	6	4061	4066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
66	NC_012969	TGC	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
67	NC_012969	TGC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
68	NC_012969	CGC	2	6	4157	4162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997716
69	NC_012969	CCAA	2	8	4223	4230	50 %	0 %	0 %	50 %	253997716
70	NC_012969	TGG	2	6	4245	4250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
71	NC_012969	GGT	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
72	NC_012969	CAAG	2	8	4276	4283	50 %	0 %	25 %	25 %	253997716
73	NC_012969	GAC	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997716
74	NC_012969	GCTAC	2	10	4441	4450	20 %	20 %	20 %	40 %	253997716
75	NC_012969	CAT	4	12	4456	4467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997716
76	NC_012969	TTG	2	6	4505	4510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997716
77	NC_012969	TTC	2	6	4517	4522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997716
78	NC_012969	TGG	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997716
79	NC_012969	CAG	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997716
80	NC_012969	CTG	2	6	4646	4651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
81	NC_012969	CCG	2	6	4762	4767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997716
82	NC_012969	TGC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
83	NC_012969	GC	3	6	4798	4803	0 %	0 %	50 %	50 %	253997716
84	NC_012969	GCCAAT	2	12	4844	4855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253997716
85	NC_012969	TTG	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997716
86	NC_012969	GCG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997716
87	NC_012969	CTG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997716
88	NC_012969	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997716
89	NC_012969	ACC	2	6	5216	5221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997716
90	NC_012969	GAT	2	6	5261	5266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997716
91	NC_012969	CAC	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997716
92	NC_012969	TGC	2	6	5464	5469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997717
93	NC_012969	CAC	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997717
94	NC_012969	GAA	2	6	5505	5510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253997717
95	NC_012969	GTT	2	6	5573	5578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997717
96	NC_012969	ATC	2	6	5638	5643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997717
97	NC_012969	CA	3	6	5688	5693	50 %	0 %	0 %	50 %	253997717
98	NC_012969	GGC	2	6	5715	5720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997717
99	NC_012969	GCT	2	6	5737	5742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997717
100	NC_012969	CAT	2	6	5789	5794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997717
101	NC_012969	AGC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997717
102	NC_012969	GGC	2	6	5883	5888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997717
103	NC_012969	TGA	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997717
104	NC_012969	CG	3	6	5978	5983	0 %	0 %	50 %	50 %	253997717
105	NC_012969	CGTA	2	8	6003	6010	25 %	25 %	25 %	25 %	253997717
106	NC_012969	GGT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253997717
107	NC_012969	CCA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997717
108	NC_012969	GCT	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997717
109	NC_012969	CCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253997717
110	NC_012969	CG	3	6	6150	6155	0 %	0 %	50 %	50 %	253997717
111	NC_012969	GCG	2	6	6225	6230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997717
112	NC_012969	GCC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997717
113	NC_012969	GGC	2	6	6284	6289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997717
114	NC_012969	GGC	2	6	6309	6314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997717
115	NC_012969	GCC	2	6	6370	6375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997717
116	NC_012969	GC	3	6	6459	6464	0 %	0 %	50 %	50 %	253997717
117	NC_012969	TCT	2	6	6529	6534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997717
118	NC_012969	TGCCGA	2	12	6587	6598	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253997717
119	NC_012969	CTG	2	6	6619	6624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997717
120	NC_012969	TTA	2	6	6848	6853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253997718
121	NC_012969	TGT	2	6	6858	6863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997718
122	NC_012969	T	7	7	6906	6912	0 %	100 %	0 %	0 %	253997718
123	NC_012969	CTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997718
124	NC_012969	CAT	2	6	6928	6933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997718
125	NC_012969	GCA	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997718
126	NC_012969	TGA	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997718
127	NC_012969	AGGG	2	8	7068	7075	25 %	0 %	75 %	0 %	253997718
128	NC_012969	TGC	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997718
129	NC_012969	GTT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997718
130	NC_012969	GAT	2	6	7175	7180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997718
131	NC_012969	CCA	2	6	7264	7269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253997718
132	NC_012969	TGC	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253997718
133	NC_012969	CTT	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997718
134	NC_012969	GAG	2	6	7327	7332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253997718
135	NC_012969	GTACGC	2	12	7402	7413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	253997718
136	NC_012969	GCC	2	6	7416	7421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253997718
137	NC_012969	CTT	2	6	7462	7467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253997718
138	NC_012969	GGC	2	6	7516	7521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997718
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142	NC_012969	GCA	2	6	7666	7671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997718
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147	NC_012969	A	7	7	7917	7923	100 %	0 %	0 %	0 %	253997719
148	NC_012969	CAT	2	6	7943	7948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997719
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155	NC_012969	GCA	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253997720
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255	NC_012969	CATCAG	2	12	13624	13635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253997724
256	NC_012969	A	6	6	13636	13641	100 %	0 %	0 %	0 %	253997724
257	NC_012969	AACC	2	8	13870	13877	50 %	0 %	0 %	50 %	253997725
258	NC_012969	CAA	2	6	13892	13897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253997725
259	NC_012969	ATG	2	6	13902	13907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253997725
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391	NC_012969	TACA	2	8	21580	21587	50 %	25 %	0 %	25 %	253997729
392	NC_012969	CAT	2	6	21591	21596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253997729
393	NC_012969	TTG	2	6	21680	21685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253997729
394	NC_012969	GGC	2	6	21696	21701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253997729
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